当车辆扣分超过12分时，驾驶人需要按照以下步骤处理：
在扣除12分后的15天内，前往当地车管所参加为期7天的道路交通安全法律法规培训。
培训完成后，交通部门会组织车主进行科目一的考试。只有通过科目一的考试，驾驶证才会发还给车主。
如果考试未通过，则需要重新参加培训并再次考取科目一，直到考试合格为止。
如果在一个积分周期里，累计超过了24分，那么除了参加科目一考试，还需要参加科目三的考试。
如果违章行为已经开具了罚单，驾驶人需要前往指定的违法罚款缴纳点（例如银行）缴纳罚款。如果还没有出具具体罚单，则需要带上驾驶证和行驶证到交警队确认违法。
若驾驶人未在规定的15天内参加学习或未通过考试，交管部门有权暂停其驾驶证的使用，并公告其驾驶证停止使用。
通过以上步骤，驾驶人可以重新获得驾驶资格并清除扣分记录。建议驾驶人尽快处理违章行为，以免影响正常驾驶和驾驶证的使用。